MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL48

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014135	T	7	7	195	201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014135	CGA	2	6	273	278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014135	TGA	3	9	348	356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014135	GCA	2	6	399	404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014135	CAA	2	6	462	467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014135	A	7	7	577	583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014135	TGA	2	6	588	593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014135	A	7	7	613	619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014135	ACCT	2	8	630	637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014135	AAAAT	2	10	647	656	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014135	AAC	2	6	689	694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014135	A	6	6	725	730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014135	A	6	6	802	807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014135	TAG	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014135	TAT	2	6	849	854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014135	TGA	2	6	864	869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014135	A	6	6	880	885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014135	A	6	6	943	948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014135	TGA	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014135	TGTC	2	8	1090	1097	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014135	TGC	2	6	1123	1128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014135	T	7	7	1218	1224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014135	G	7	7	1357	1363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014135	TAC	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014135	C	7	7	1394	1400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_014135	TTG	2	6	1539	1544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014135	AAT	2	6	1547	1552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014135	ATA	2	6	1566	1571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014135	GTG	2	6	1572	1577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014135	ATTTA	2	10	1585	1594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014135	A	6	6	1604	1609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014135	A	7	7	1623	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	296005659
33	NC_014135	TAGCTT	2	12	1714	1725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296005659
34	NC_014135	AGA	2	6	1727	1732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296005659
35	NC_014135	A	8	8	1756	1763	100 %	0 %	0 %	0 %	296005659
36	NC_014135	TTG	2	6	1809	1814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014135	AGA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296005660
38	NC_014135	AATT	2	8	1918	1925	50 %	50 %	0 %	0 %	296005660
39	NC_014135	GATAAA	2	12	1956	1967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296005660
40	NC_014135	A	6	6	1992	1997	100 %	0 %	0 %	0 %	296005660
41	NC_014135	TGT	2	6	2009	2014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296005660
42	NC_014135	AAC	2	6	2065	2070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296005660
43	NC_014135	AAG	2	6	2111	2116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296005660
44	NC_014135	GTAT	2	8	2125	2132	25 %	50 %	25 %	0 %	296005660
45	NC_014135	GAA	2	6	2168	2173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296005660
46	NC_014135	ATA	2	6	2185	2190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296005660
47	NC_014135	TTAA	2	8	2205	2212	50 %	50 %	0 %	0 %	296005660
48	NC_014135	GATA	2	8	2226	2233	50 %	25 %	25 %	0 %	296005660
49	NC_014135	TA	3	6	2232	2237	50 %	50 %	0 %	0 %	296005660
50	NC_014135	TGATT	2	10	2282	2291	20 %	60 %	20 %	0 %	296005660
51	NC_014135	AAT	2	6	2375	2380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296005660
52	NC_014135	TAA	2	6	2410	2415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296005660
53	NC_014135	AAAAT	2	10	2516	2525	80 %	20 %	0 %	0 %	296005660
54	NC_014135	ACTG	2	8	2539	2546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014135	TCAG	2	8	2551	2558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014135	T	7	7	2559	2565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014135	CTCG	2	8	2590	2597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014135	CCG	2	6	2637	2642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014135	ATA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014135	CTA	2	6	2708	2713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014135	TACTT	2	10	2757	2766	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014135	ATTT	2	8	2788	2795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014135	A	6	6	2820	2825	100 %	0 %	0 %	0 %	296005661
64	NC_014135	TTG	2	6	2835	2840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296005661
65	NC_014135	A	7	7	2901	2907	100 %	0 %	0 %	0 %	296005661
66	NC_014135	GAA	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296005661
67	NC_014135	GAT	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296005661
68	NC_014135	TAT	2	6	2953	2958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296005661
69	NC_014135	A	6	6	2991	2996	100 %	0 %	0 %	0 %	296005661
70	NC_014135	TGT	2	6	3037	3042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296005661
71	NC_014135	ATA	2	6	3047	3052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296005661
72	NC_014135	TA	4	8	3072	3079	50 %	50 %	0 %	0 %	296005661
73	NC_014135	A	6	6	3099	3104	100 %	0 %	0 %	0 %	296005661

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.